После победы над Мехагодзиллой мир титанов и людей находится в хрупком равновесии. Конг правит в Полой Земле, а Годзилла защищает поверхность планеты. Однако таинственный сигнал, обнаруженный исследователями «Монарха», нарушает спокойствие. В центре событий оказывается Дия — девушка со способностями к телепатии, её приёмная мать Айлин и команда исследователей. Они обнаруживают в Полой Земле новое племя гигантских обезьян под предводительством тиранического Кинг Скара. Он управляет древним титаном Шимо, обладающим ледяной силой. Годзилле, Конгу и их человеческим союзникам предстоит остановить новую угрозу, которая может привести к глобальной катастрофе.